L’essentiel
- Le POP-7 est le polymère polyvalent pour le séquençage et l’analyse de fragments.
- Le POP-6 offre une meilleure résolution en séquençage, avec des migrations plus longues.
- Le POP-4 est optimisé pour l’analyse de fragments en identification humaine (HID).
- Les poches contiennent 96, 384 ou 960 échantillons et se conservent entre 2 et 8 °C. Sur l’instrument, elles tiennent jusqu’à 14 jours à 25 °C ou moins ; au-delà de 25 °C, le POP-7 tient 7 jours.
Poches disponibles
| Produit | Taille de poche | Usage typique | Pour | Réf. OEM (comparaison) | Prix |
|---|---|---|---|---|---|
| Poche de polymère POP-7 | 96 échantillons | Séquençage et analyse de fragments | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | A26073 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-7 | 384 échantillons | Séquençage et analyse de fragments | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | 4393708 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-7 | 960 échantillons | Séquençage et analyse de fragments | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | 4393714 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-6 | 96 échantillons | Séquençage haute résolution | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | A26071 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-6 | 384 échantillons | Séquençage haute résolution | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | 4393717 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-6 | 960 échantillons | Séquençage haute résolution | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | 4393712 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-4 | 96 échantillons | Identification humaine (HID) et analyse de fragments | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | A26070 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-4 | 384 échantillons | Identification humaine (HID) et analyse de fragments | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | 4393715 | Demander le prix |
| Poche de polymère POP-4 | 960 échantillons | Identification humaine (HID) et analyse de fragments | 3500 / 3500xL / SeqStudio Flex | 4393710 | Demander le prix |
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Les références OEM servent uniquement de comparaison, pour retrouver ce que votre instrument utilise aujourd’hui.
Quel polymère choisir ?
Le POP-7 couvre la plupart des analyses de séquençage et de fragments sur le 3500 ; c’est le choix habituel quand un seul polymère doit servir tout le laboratoire. Le POP-6 sépare mieux les pics rapprochés, ce qui aide pour les matrices difficiles et la recherche de mutations, au prix de migrations plus longues. Le POP-4 est le polymère sur lequel les kits STR d’identification humaine sont généralement validés pour le 3500.
| Polymère | Usage | Exemple de module | Durée | Longueur de lecture |
|---|---|---|---|---|
| POP-7 | Séquençage, analyse de fragments | StdSeq50_POP7 | ≤ 125 min | ≥ 700 bases |
| POP-7 | Analyse de fragments rapide | FragAnalysis36_POP7 | ≤ 30 min | — |
| POP-6 | Séquençage haute résolution | StdSeq50_POP6 | ≤ 135 min | ≥ 600 bases |
| POP-4 | Identification humaine, lectures courtes | RapidSeq36_POP4 | ≤ 45 min | ≥ 400 bases |
Valeurs tirées de la fiche technique du fabricant pour les 3500/3500xL.
Pour changer de type de polymère, rincez d’abord la pompe et les canaux avec le réactif de conditionnement, puis effectuez un nouvel étalonnage spectral : chaque type de polymère nécessite son propre étalonnage spectral pour chaque jeu de colorants.
Durée sur l’instrument et limites d’injections
Une poche peut rester sur le 3500 jusqu’à 14 jours à 25 °C ou moins. Au-delà de 25 °C, le POP-7 est limité à 7 jours. L’instrument lit les jours, les injections et la date de péremption sur l’étiquette RFID de la poche et demande un remplacement dès qu’une limite est atteinte.
Le choix du format est donc une question de débit. Une poche de 960 échantillons donne 120 injections sur un 3500 (8 capillaires) et 40 sur un 3500xL (24 capillaires), mais elle doit tout de même être utilisée dans la limite de durée. Les laboratoires qui lancent peu de séries par semaine gaspillent moins avec des poches de 384 ou 96 échantillons.
Stockage et manipulation
- Conservez les poches non ouvertes entre 2 et 8 °C. Ne pas congeler.
- Laissez la poche revenir à température ambiante avant de l’installer. Le polymère froid libère des gaz dissous en se réchauffant, ce qui forme des bulles dans la pompe.
- Vérifiez la date de péremption : l’instrument refuse les poches périmées.
- Installez la poche avec l’étiquette RFID tournée vers l’instrument.
- Utilisez l’assistant Replenish Polymer pour installer une nouvelle poche plutôt que de compléter à la main.
Éviter les bulles et les problèmes de courant
La plupart des erreurs de courant instable viennent de bulles dans le circuit du polymère, d’un polymère périmé ou vieilli, d’un tampon ancien ou d’une fuite. Avant de remplacer des pièces : éliminez les bulles avec l’assistant, installez du polymère frais et de nouveaux réservoirs de tampon, et contrôlez le bloc pompe et le port du réseau. Le guide de dépannage du 3500 détaille d’autres causes par symptôme.
Questions fréquentes
Peut-on utiliser le POP-7 pour l’analyse de fragments ?
Oui. Le POP-7 sert à la fois au séquençage et à l’analyse de fragments sur le 3500. Les modules d’analyse de fragments comme FragAnalysis36_POP7 durent environ 30 minutes sur un réseau de 36 cm.
Pourquoi le 3500 refuse-t-il une poche de polymère ?
La poche est périmée, ses injections sont épuisées ou l’étiquette RFID est illisible. Vérifiez la date de péremption et la position de l’étiquette, puis réinstallez la poche.
Quel format de poche commander ?
Estimez vos injections sur 14 jours. Une poche de 960 échantillons donne 120 injections sur un 3500 et 40 sur un 3500xL. Si vous n’en utiliserez pas autant dans la limite de durée, une poche de 384 ou 96 échantillons revient moins cher par injection réellement utilisée.
Les polymères du 3500 conviennent-ils au 3730 ou au 3130 ?
Non. Les séries 3730 et 3130 utilisent du polymère en flacons, tandis que la série 3500 utilise des poches à étiquette RFID. Le tableau de compatibilité indique le format de chaque instrument.
Puis-je utiliser ces poches sur un SeqStudio Flex ?
Oui. Les poches de POP-7, POP-6 et POP-4 sont étiquetées pour le 3500 et le SeqStudio Flex, par exemple A26073 pour le POP-7 et A26071 pour le POP-6.
Le SeqStudio utilise-t-il des poches POP ?
Non. Le SeqStudio à 4 capillaires utilise le polymère POP-1 déjà contenu dans sa cartouche, il n’y a donc pas de poche séparée à commander. Voir SeqStudio.
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