先做这两步
- 先检查基本条件：聚合物和缓冲液在上机期限内、泵内无气泡、温箱已预热至少 30 分钟，并且在开始运行前状态灯为绿色。
- 运行测序标准品或片段大小标准品。标准品正常，问题出在样本；标准品异常，则应检查仪器和耗材。
数据质量问题
电泳图中出现尖峰
可能原因
- 气泡或颗粒经过检测窗口。
- 阵列接口或泵块中有干涸的聚合物或结晶。
- 电弧引起的电噪声。
解决方法
- 运行排气泡向导。
- 安装已恢复至室温的新鲜聚合物袋。
- 清洁泵块，检查阵列接口有无干涸的聚合物。
- 确保阴极缓冲液容器顶部干燥。
信号弱或无信号
可能原因
- 模板量不足，或 PCR、测序反应失败。
- 盐分或残留的染料终止子在电动进样时形成竞争。
- 甲酰胺变质。
- 孔底有气泡。
- 毛细管堵塞。
解决方法
- 运行标准品，区分样本问题与仪器问题。
- 检查反应和纯化步骤。
- 使用冻存分装的新鲜甲酰胺。
- 将样品板短暂离心以去除气泡。
- 检查运行模块中的进样电压和时间。
峰变宽或分辨率差
可能原因
- 聚合物已超过上机期限。
- 毛细管阵列接近使用寿命。
- 样本过载或含盐过高。
- 温箱未预热或运行温度不正确。
解决方法
- 更换新鲜聚合物，检查阵列的进样次数。
- 稀释样本或缩短进样时间。
- 温箱至少预热 30 分钟。
- 如果标准品的四种颜色也都出现宽峰，请更换阵列。
Pull-up 峰（颜色串扰）
可能原因
- 光谱校准已过时，或是在另一阵列、另一聚合物下完成的。
- 样本过载，信号超出检测器量程。
解决方法
- 减少上样量或缩短进样时间。
- 为该染料组重新进行光谱校准。
- 每次更换阵列和聚合物类型后都要重新校准。
测序数据中的染料峰（dye blob）
可能原因
- 纯化不完全，残留未掺入的染料终止子。
- 运行模块与纯化化学方法不匹配。
解决方法
- 改进循环测序后的纯化步骤。
- 使用与纯化方法相匹配的运行模块。
不同运行之间迁移偏移
可能原因
- 当天第一次运行在温箱稳定之前就开始了。
- 缓冲液或聚合物老化。
- 室内温度变化较大。
解决方法
- 温箱至少预热 30 分钟。
- 在期限内更换缓冲液容器和聚合物。
- 保持室温稳定；片段分析的每个样本中都应加入片段大小标准品。
仪器错误
电流不稳定错误
可能原因
- 泵块或聚合物通路中有气泡，这往往同时导致尖峰。
- 聚合物通路泄漏。
- 聚合物过期或老化。
- 电泳缓冲液上机超过两周。
- 电弧、未按时维护或硬件故障。
解决方法
- 运行排气泡向导。
- 检查泵块和阵列接口有无泄漏。
- 运行冲洗向导，然后安装新鲜聚合物和两只新的缓冲液容器。
- 擦干阴极缓冲液容器顶部。
- 若错误仍然存在，请联系维修。
电弧或运行中断
可能原因
- 阴极缓冲液容器顶部或隔垫上有水分或盐分。
- 电极上有干涸的聚合物或盐分。
解决方法
- 安装隔垫前将容器顶部完全擦干。
- 用无绒纸巾擦拭电极。
泵或阵列接口泄漏
可能原因
- 阵列未完全插好。
- 密封件磨损或泵块部件损坏。
解决方法
- 重新安装阵列并检查泵块。
- 不要过度拧紧接头。
- 若泄漏持续，请联系维修。
阵列卡住无法移动或取下
可能原因
- 阵列头部周围有干涸的聚合物。
解决方法
- 在阵列头部周围喷洒去离子水后再试。
- 切勿用力或使用工具。若仍无法移动，请申请上门服务。
空间校准或光谱校准失败
可能原因
- 阵列未安装到位，或毛细管未完全充满聚合物。
- 检测窗口不洁净。
- 校准板孔内有气泡，或标准品已过期。
解决方法
- 重新安装阵列并灌注聚合物。
- 离心校准板以去除气泡，并检查标准品有效期。
- 重新校准。
状态灯为黄色或红色
含义
- 黄灯常亮：电脑与仪器无法通信。
- 红灯常亮：仪器无法初始化。
解决方法
- 按用户手册规定的启动顺序重启电脑和仪器。
- 等待绿灯亮起后再开始运行。
- 若红灯再次出现，请联系维修。
预防问题
上述大多数问题都可以通过日常维护避免：在期限内更换聚合物和缓冲液，每月冲洗泵，每次更换阵列后进行校准。3500 维护清单将这些工作汇总在一页可打印的表格中。
常见问题
如何判断问题来自样本还是仪器？
在同一阵列上运行测序标准品或片段大小标准品。标准品正常，请检查样本制备和纯化；标准品出现同样问题，原因在于仪器或耗材。
什么时候应该更换毛细管阵列？
当标准品的四种颜色都出现宽峰、读长变短或分辨率变差，或阵列已达到进样次数上限或有效期时。
寻求帮助时应提供哪些信息？
仪器型号和序列号、软件版本、试剂盒及批号、阵列已运行次数、聚合物、缓冲液和甲酰胺的批号，以及几份能体现问题的数据文件。
我的 3500 拒绝一根数据仍然良好的阵列，怎么办？
该阵列可能已达到其 RFID 标签中存储的进样次数上限或有效期。使用再生阵列，或通过在线再生更换新的 RFID 标签，即可继续使用。详见再生阵列。